关键词:生物信息学、序列比对

序列比对

1,基于动态规划:最优比对(打分最高的比对方式,矩阵(Match=2,Unmatch=-1),路径(回溯、多条))

2,最长公共子序列LCS:问题(给定x,y两个字符串,找出最长公共子序列及其长度)、公共子序列个数(不连续,个数(得分改变次数),具体字符(得分改变字符))、递归公式(c[i][j],矩阵(匹配+1,Max(左、上)))、

动态规划比对

最长公共子序列1a-描述

最长公共子序列1b-矩阵

最长公共子序列2a-递归描述

最长公共子序列2b-矩阵

最长公共子序列2c-代码

参考资料:

序列比对动态规划矩阵[生物信息学]

动态规划:最长公共子序列问题。讲解

[轻松掌握动态规划]5.最长公共子序列 LCS